美国博德研究所MichaelA.Gillette等研究人员合作绘制出乳腺癌肿瘤发生和靶向治疗的蛋白基因组学图谱。相关论文于年11月18日在线发表在《细胞》杂志上。
研究人员表示，基于质谱的蛋白质组学与下一代DNA和RNA测序的集成可更全面地分析肿瘤。
研究人员发现，这种“蛋白质组学”方法适用于种未经治疗的原发性乳腺癌，这些乳腺癌可保留翻译后修饰，包括蛋白质磷酸化和乙酰化。蛋白质组学挑战了标准的乳腺癌诊断，提供了对ERBB2扩增子的详细分析，确定了可从免疫检查点治疗中受益的肿瘤亚群，并能够更准确地评估Rb的状态以预测CDK4/6抑制剂的反应性。磷酸化蛋白质组学分析发现了肿瘤抑制因子丧失与可靶向激酶之间的新型关联。
乙酰蛋白质组分析突出显示了参与DNA损伤反应的关键核蛋白的乙酰化作用，并揭示了细胞质和线粒体乙酰化作用与代谢之间的相互影响。这些结果通过更准确地注释可靶向途径和这种显著异质性恶性肿瘤的生物学特征，突出了蛋白质组学在乳腺癌临床研究中的潜力。
附：英文原文
Title:ProteogenomicLandscapeofBreastCancerTumorigenesisandTargetedTherapy
Author:KarstenKrug,EricJ.Jaehnig,ShankhaSatpathy,LiliBlumenberg,AllaKarpova,MeenakshiAnurag,GeorgeMiles,PhilippMertins,YifatGeffen,LaurenC.Tang,DavidI.Heiman,SongCao,YosefE.Maruvka,JonathanT.Lei,ChenHuang,RamaniB.Kothadia,AntonioColaprico,ChetBirger,JareyWang,YongchaoDou,BoWen,ZhiaoShi,YuxingLiao,MaciejWiznerowicz,MatthewA.Wyczalkowski,XiStevenChen,JacobJ.Kennedy,AmandaG.Paulovich,MathangiThiagarajan,ChristopherR.Kinsinger,TaraHiltke,EmilyS.Boja,MehdiMesri,AnaI.Robles,HenryRodriguez,ThomasF.Westbrook,LiDing,GadGetz,KarlR.Clauser,DavidFeny,KellyV.Ruggles,BingZhang,D.R.Mani,StevenA.Carr,MatthewJ.Ellis,MichaelA.Gillette,ShayanC.Avanessian,ShuangCai,DanielChan,XianChen,NathanJ.Edwards,AndrewN.Hoofnagle,M.HarryKane,KarenA.Ketchum,EricKuhn,DouglasA.Levine,ShunqiangLi,DanielC.Liebler,TaoLiu,JingqinLuo,SubhaMadhavan,ChrisMaher,JasonE.McDermott,PeterB.McGarvey,MauricioOberti,AkhileshPandey,SamuelH.Payne,DavidF.Ransohoff,RobertC.Rivers,KarinD.Rodland,PaulRudnick,MelindaE.Sanders,KennaM.Shaw,Ie-MingShih,RobbertJ.C.Slebos,RichardD.Smith,MichaelSnyder,StephenE.Stein,DavidL.Tabb
IssueVolume:-11-18
Abstract:Theintegrationofmassspectrometry-basedproteomicswithnext-generationDNAandRNAsequencingprofilestumorsmore